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Enregistrement W7052177582

The roles of SH2-containing inositol 5'-phosphatase 1 (SHIP1) and signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) in interleukin-10 regulation of activated macrophages

2016· other· en· W7052177582 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2016
Typeother
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHealth Canada
Mots-clésTranscription (linguistics)Transcription factorSignal transductionImmune systemActivator (genetics)STAT proteinCytokine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammation is a protective mechanism against infection, but it must be appropriately regulated to prevent pathological consequences including inflammatory diseases. Interleukin-10 (IL-10) is a key anti-inflammatory cytokine that inhibits the activation of many immune cell types, including the macrophage, to prevent exaggerated immune responses. Understanding the signalling pathway downstream of IL-10 and IL-10 receptor (IL-10R) is essential in developing therapeutics to treat inflammatory diseases. Canonically, IL-10R signalling is described as solely depending on the activation of the transcription factor STAT3 and the expression of STAT3-response genes. However, our laboratory has previously shown that IL-10 also activates the inositol 5'-phosphatase SHIP1 to mediate its anti-inflammatory responses, such as inhibiting the expression of pro-inflammatory cytokines. Moreover, we have now found that IL-10 is able to inhibit expression of miRNA-155 (miR-155) in macrophages activated by the bacterial product lipopolysaccharide (LPS). This inhibition by IL-10 requires both STAT3 and SHIP1, and occurs at the maturation step, but not at the transcription step, of miR-155. Consistent with SHIP1’s involvement in IL-10 function, a previously described SHIP1 activator, AQX-MN100, mimics IL-10 and inhibits LPS-induced miR-155. Next, we investigated the roles of STAT3 and SHIP1 in IL-10 regulation of global gene expression in activated macrophages. Among the genes identified as IL-10 regulated, we have found different subsets of genes potentially to be SHIP1-regulated, STAT3-regulated, and SHIP1-STAT3 regulated. Considering the importance of SHIP1 activation in IL-10 function, SHIP1 activators provide an alternate way to control inflammation. We have previously shown that SHIP1 activators bind to SHIP1’s C2 domain and regulate SHIP1 enzymatic activity allosterically. Using x-ray crystallography, we obtained the crystal structure of SHIP1’s phosphatase and C2 domains, the minimal region necessary for allosteric activation by SHIP1 activators. Analysis of the crystal structure revealed differences between SHIP1 and related phosphatases. Biochemical and biophysical methods have been employed to identify amino acid residues potentially interacting with SHIP1 activators. Together, this work strengthens the model that STAT3 and SHIP1 work together to mediate the anti-inflammatory function of IL-10. We also described the structure of SHIP1, providing the first step in rational drug design to generate better small molecule SHIP1 activators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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