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Enregistrement W7053276934

Understanding Type A Clostridium perfringens in Foal Necrotizing Enteritis and Canine Acute Hemorrhagic Diarrhea

2018· dissertation· en· W7053276934 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2018
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueElectrostatic Discharge in Electronics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFoalClostridium perfringensPlasmidVirulenceEnteritisDiarrheaLocus (genetics)Pathogenicity
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of type A Clostridium perfringens in foal necrotizing enteritis and canine acute hemorrhagic diarrhea is poorly understood. However, recently, we described a highly significant association between the presence of novel toxigenic C. perfringens and these specefic enteric diseases. These strains produce three novel putative toxins related to the beta-sheet pore-forming toxin family, which were designated NetE, NetF, and NetG. Our group demonstrated that NetF is likely the major virulence factor in strains responsible for canine acute hemorrhagic diarrhea and foal necrotizing enteritis. This thesis contains three studies aimed at expanding the understanding of netF-positive C. perfringens. In the first study, the genome of two NetF-producing strains, JFP838 and JFP55, which were isolated from cases of canine acute hemorrhagic diarrhea and foal necrotizing enteritis, respectively, were sequenced. Results of this research indicated that NetF and NetE were encoded by the same pathogenicity locus (NetF locus) on a tcp-conjugative plasmid and that NetG was encoded by a second plasmid (pNetG) on a unique pathogenicity locus (NetG locus). In addition, these two isolates shared three plasmids, including the netF/netE plasmid (pNetF), a cpe/cpb2 plasmid (pCPE), and a small bacteriocin-encoding plasmid (pBCN). In the second study, 30 NetF-producing strains were sequenced to determine whether the newly described pathogenicity loci are conserved, and all netF-positive isolates harbour the same plasmid profile. In addition, the genetic relatedness of these isolates were examined by core genome multilocus sequence typing (cgMLST). The bioinformatics analysis showed that in pNetF and pNetG, if present, pathogenicity loci are highly conserved among netF-positive strains. The common plasmid profile (pNetF, pCPE, and pBCN) was found in all NetF-producing strains and these strains were found to belong to two clonal populations. In the third study, pore-forming activity of the NetF toxin and the chemical nature of its receptor was investigated. The results demonstrated for the first time that NetF is able to create large pores on cell membranes and that its binding site is most likely a sialic acid-containing glycoprotein. Overall, this thesis has contributed significantly to the current knowledge of evolution, relationships, and pathogenesis of netF-positive C. perfringens infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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