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Enregistrement W7055017830

Analyzing Alzheimer's disease progression from sequential magnetic resonance imaging scans using deep convolutional neural networks

2019· dissertation· en· W7055017830 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueLaser Design and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésMagnetic resonance imagingDiseaseFunctional magnetic resonance imagingConvolutional neural networkNeural activity
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer's disease is a progressive, neurodegenerative disease that at the moment is typically diagnosed from the symptoms of dementia, such as a decline in cognitive abilities, visual and/or speech impairment, loss of memory, rather than the structural changes in the brain that cause it.Neuroimaging modalities, such as Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans, have the capacity to capture tissue changes in the brain.But human visual inspection Résumé La maladie d'Alzheimer est une maladie neurodégénérative progressive qui est généralement diagnostiquée à partir de symptômes de démence, tels que la diminution des fonctions cognitives, troubles visuels et/ou trouble de la parole, ainsi que la perte de mémoire plutôt qu'à partir de changements structurels du cerveau (biomarqueur) qui causent cette maladie.Les neuroimages telles l'imagerie par résonance magnétique (IRM) ont la capacité de capter?ces biomarqueurs.Cependant, l'inspection visuelle humaine est limitée et dépend de facteurs tels que l'expérience du radiologue.De plus, les changements au niveau du cerveau commencent au moins 30 ans avant que la maladie se manifeste.Par conséquent, pouvoir prédire la probabilité qu'un patient soit affecté par la maladie d'Alzheimer basé sur son état actuel constitue une source d'information clinique inestimable.Dans ce projet, nous visons à résoudre ce problème en prédisant les chances qu'une personne sera atteinte d'Alzheimer dans le futur proche (6 mois), compte tenu de son IRM T1 actuel.Nous avons entraîné un réseau neuronal convolutif tridimensionnel régularisé par un autoencodeur pour apprendre les biomarqueurs pertinents pour la détection de la maladie d'Alzheimer et avons atteint une précision (test) de 81.93%.Étant donné que la maladie peut évoluer de différentes manières à partir de l'état physiologique actuel d'un patient, nous souhaitons modéliser la distribution par rapport à d'éventuels états futurs de la maladie.Pour apprendre cette correspondance entre chaque état de l'IRM actuel et l'étiquette de maladie de l'état suivant, nous avons entraîné un auto-encodeur variationnel en supposant que la distribution latente est gaussienne.Le modèle entraîné a appris la distribution avec succès et est capable de prédire les différents états pathologiques dans lesquels un patient est susceptible de progresser.CONTENTS v 2.4.1 Initialization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2.4.2Batch Normalization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2.4.3Cost Functions . . . . . . . .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,097

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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