Developing Platforms for Solid-Phase Bioaffinity Assays Using Nucleic Acid Aptamers
Notice bibliographique
Résumé
This thesis focuses on devising strategies for immobilizing nucleic acid aptamers on or in solid supports that improve their stability, availability for binding interactions and compatibility with emerging solid-phase bioanalysis applications. The work begins with the entrapment of labile RNA-based aptamers within a sol-gel derived material for bio-immobilization without the need for extraneous binding molecules or complex conjugation procedures. A hybrid organic-inorganic material provided the best matrix environment not only for RNA functionality but protection from both nuclease attack and chemical degradation, enhancing long-term stability when compared to solution. To expand the application of aptamer/sol-gel biohybrids, rolling circle amplification was used to generate long DNA molecules containing concatemeric aptamer sequences. A high-throughput screen was used to identify materials with macropores that allowed for minimal leaching and high activity and of the entrapped concatemeric DNA aptamers. The optimal concatemer-entrapped material was used to make monolithic columns for flow-based detection of both small molecules and high molecular weight proteins, thus, broadening the range of analytes that can interact with sol-gel entrapped aptamers to include large macromolecules. To further expand the utility of concatemeric aptamers, these large molecules were inkjet-printed as “bioinks” on paper as an alternative means of producing paper-based sensing devices in a simple and inexpensive manner. The large structure of the concatemeric aptamer molecules allowed direct bio-immobilization through strong adsorption on cellulose without the need for surface conjugation or material entrapment. Although these concatemers remained immobilized after liquid elution over the printing area, they retained sufficient segmental motion for target binding and signaling on the paper surface. Patterning letters/symbols to create internally-referenced and multiplexed assays for both qualitative and quantitative detection of small molecules and proteins, demonstrated a generic platform for on-demand printing of aptamer-based solid-phase assays in the emerging field of paper-based sensors for on-site detection applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».