CYP2A6 and CYP2B6: Sources of Variation and their Role in Nicotine Metabolism
Notice bibliographique
Résumé
Nicotine is the primary substance in tobacco causing addiction. In humans the majority (70-80%) of nicotine is inactivated to cotinine in a reaction predominantly catalyzed by CYP2A6 (80-90%), with a minor possible role for CYP2B6. Substantial interindividual variability is observed in the rate of nicotine’s inactivation to cotinine and this variation contributes to differences in smoking behaviors (e.g. cigarette consumption). Twin studies suggest an important genetic contribution to the variability in nicotine metabolism. However in 2004, genetic variation in CYP2A6 and CYP2B6 accounted for only a small portion of the variability suggesting gaps in our knowledge. Our objective was to identify additional genetic and non-genetic sources of variability in CYP2A6 expression/activity, CYP2B6 expression, and nicotine to cotinine metabolism in vivo and/or in vitro. Participants included individuals from different world populations phenotyped for CYP2A6 activity either following oral nicotine administration or using metabolite ratios derived from baseline smoking. Genotyping and sequencing were utilized to identify and characterize multiple new CYP2A6 alleles. In total 17 novel CYP2A6 alleles were identified, many of which were found predominantly among individuals of black African descent and exhibited lower CYP2A6 activity. In addition, human livers were assessed for CYP2A6 and CYP2B6 expression and nicotine to cotinine metabolism. The mechanisms underlying the lower CYP2A6 activity associated with some of the variant CYP2A6 alleles included either a reduction in hepatic CYP2A6 protein expression, an alteration of CYP2A6’s structural property, or a combination of both. DNA methylation was not associated with altered hepatic CYP2A6 expression/activity. Livers from female donors were associated with higher CYP2A6 and CYP2B6 protein expression compared to male livers, while age did not influence the expression of either CYP. Finally, CYP2B6 and its prevalent altered function genetic variant (CYP2B6*6) did not influence nicotine to cotinine metabolism. Identification of factors that contribute to the variability in CYP2A6 and nicotine metabolism is important to improve future association studies between CYP2A6 genotype, nicotine metabolism, and smoking behaviors. In addition, this information could provide the potential to personalize therapy in order to improve the clinical efficacy of nicotine, particularly as a smoking cessation aid.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».