Distribution of antimicrobial resistance genes and class 1 integrons in Escherichia coli from Canadian beef cattle
Notice bibliographique
Résumé
This study examined the distribution of antimicrobial resistance (AMR) genes and characterized class 1 integrons in 'Escherichia coli' from Canadian beef cattle. 'Escherichia coli' isolated from beef cattle at abattoirs were screened for the presence of genes conferring resistance to aminoglycosides, [beta]-lactams, fluoroquinolones, phenicols, sulfonamides, tetracycline, and trimethoprim. The distribution of AMR genes and observed statistical associations between genes were similar to previous studies. A novel association between the 'floR' and ' bla'CMY-2 genes caused by clustering of these two mobile resistance genes on a single plasmid was identified. 'Escherichia coli ' isolated from beef cattle at abattoirs and feedlots were screened for the presence of the 'intI1' gene of class 1 integrons. All the identified class 1 integrons were characterized to identify which gene cassettes and variants they possessed. A variety of gene cassettes and gene cassette combinations were identified in 'E. coli' from both abattoirs and feedlots, some of them new for 'E. coli' and for bacteria from cattle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».