Evaluating aptamers for their application in T cell magnetic nanoparticle-based isolation
Notice bibliographique
Résumé
Chimeric Antigen Receptor (CAR) T cell therapy is a relatively new anti-cancer therapeutic strategy, with several treatments already approved by the Food and Drug Administration (FDA).In this technology, a patient's T cells are removed and genetically engineered to express cell receptors commonly found on cancer cells and act as a "living drug" when readministered into the patient.Magnetic-based cell sorting strategies have become increasingly useful for isolating the necessary T cells from patients, relying on cell specific antibodies.The increased use of antibody-based isolation of cells is surprising given the current limitations including reduction of cell viability post-isolation thereby hindering the efficacy of downstream CAR T cell applications.Alternative affinity reagents such as stable nucleic acid aptamers instead of antibodies could address these limitations, improving the efficacy of CAR T cell treatment.In this thesis, I compared aptamers for different T cell receptors and conjugated them to magnetic nanoparticles for the application of developing a T-cell capture system.First, I functionalized both uncoated and silica-coated magnetic nanoparticles (MNPs) with streptavidin.Following surface property and binding characterizations, I selected silica coated beads as optimal for magnetic cell capture.Next, I identified reported aptamers that bind to important T cell receptors including CD3, CD4, and CD8.Using flow cytometric analysis, I performed a head-to-head comparison of their interaction properties including binding affinity and specificity.The study demonstrated that the aptamers were sensitive to buffer and temperature conditions: small changes impacted both tight binding and specificity.The aptamers
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».