Epigenetic responses to oil exposure in wild Arctic seabird populations
Notice bibliographique
Résumé
Anthropogenic pollution has been shown to have detrimental effects on organismal physiology, behavior, and fitness, but the underlying genomic mechanisms mediating these effects are not well understood.Epigenetic regulation, such as DNA methylation, has been proposed as a potential mechanism mediating these effects but currently there are few studies in natural populations.Here, I examined the methylation patterns of liver tissues from black guillemot (Cepphus grylle) in regions in the Canadian Arctic with different histories of exposure to polycyclic aromatic compounds (PACs).When compared to a reference site, I observed that all three sites with PACs exposure share a core set of differentially methylated regions (DMRs), implying that there are some consistent methylation responses to these compounds.However, the two sites with shortterm exposure to anthropogenic sources of PACs shared more DMRs than they did with the site experiencing chronic exposure to natural PACs.Furthermore, I found that when compared to a reference site with very low PACs exposure, populations that have been exposed to anthropogenic PACs are characterized by having DMRs with significantly greater ratios of hypermethylated to hypomethylated versus the population experiencing chronic exposure to natural PACs.Taken together, these results imply that the specific composition and exposure length of PACs might influence the direction of the epigenetic response.This study provides novel insights into the epigenetic mechanisms underlying biological responses to anthropogenic oil pollution.The identified DMRs serve as a genomic resource for further research investigating the functional role of DNA methylation in response to anthropogenic oil pollution.I am extremely grateful to my supervisor, Dr. Rowan Barrett, for giving me the invaluable opportunity to pursue graduate studies.Throughout the process, I have appreciated the level of autonomy he provided me in working on my thesis, as well as his insightful guidance whenever I needed it.Thank you also to Dr. Jennifer Provencher and Dr. Kyle Elliott for serving as members of my supervisory committee, providing me valuable advice and feedback through their expertise
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».