Genetic mapping of leaf rust (Puccinia triticina Eriks.) resistance in durum wheat (Triticum turgidum var. durum L.)
Notice bibliographique
Résumé
Leaf rust, caused by Puccinia triticina Eriks. (Pt = P. recondita Rob. Ex Desmaz. F. sp. tritici), is an economically significant pathogen affecting durum wheat (Triticum turgidum var. durum L.) crops worldwide. Genetic resistance is one of the most effective and environmentally friendly methods to control leaf rust in wheat. New sources of resistance genes need to be identified due to the threat of new Pt races to durum wheat production. Marker assisted selection (MAS) is a highly efficient method to select resistance genes in breeding programs particularly to pyramid multiple resistance genes in new varieties. The objective of this study was to characterize and map leaf rust resistance genes in a Canadian durum wheat Strongfield. A double haploid (DH) mapping population of 87 DH lines was developed from the cross Strongfield/Blackbird. Seedling rust tests with Pt isolates 12-3 MBDS, 06-1-1 TDBG, 128-1 MBRJ, 74-2 MGBJ, and 77-2 TJBJ revealed a single hypersensitive leaf rust resistance gene. Three genes segregated for resistance to isolate 1-1 BBBD at the seedling stage, one of which controlled resistance to the other five Pt isolates. Blackbird contributed one of the seedling resistance genes effective against isolate 1-1 BBBD. Parental lines and 87 DH lines were genotyped using the Illumina Infinium assay with the iSelect 90K wheat SNP array. A database search using the DNA sequences of linked markers provided a putative location in the Chinese Spring reference genome sequence. The gene conferring resistance to the six isolates used in the study mapped to the long arm of chromosome 3A and was temporarily designated as LrStr_3A. No leaf rust resistance gene has been detected in this region previously. Quantitative trait locus (QTL) analysis identified eight QTL controlling leaf rust resistance in field leaf rust nurseries. One of these QTL mapped to chromosome 3AL as the same region of LrStr_3A. Another QTL mapped to the expected location of the adult plant resistance (APR) gene Lr46 based upon the marker csLV46G22. Kompetitive allele-specific PCR (KASP) markers were developed for LrStr_3A that will be useful for MAS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».