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Enregistrement W7056604580

Flexible modelling of optimal dynamic treatment regimes for censored outcomes

2020· dissertation· en· W7056604580 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2020
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésBayesian probabilityMargin (machine learning)Work (physics)Stability (learning theory)Population
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In clinical practice, physicians aim to provide the best medical therapy to patients.This may require fine-tuning treatments, or choosing different treatments for two patients who have the same diagnosis due to differences in patient-level characteristics.Using data to develop rules for personalizing treatment strategies is known as precision medicine, or dynamic treatment regimes (DTRs), where the treatment or recommendation of a physician is based on the patients history (including past treatments), risk factors, and any other patient-specific information that may be considered to tailor therapeutic decisions.To date, there are relatively few methods that have been proposed for estimating DTRs to optimize censored outcomes.Clearly, flexible and efficient prediction models are desirable, to maximize accuracy in predicting optimal treatments for individual patients while accommodating censored data and complex interactions between patient factors and treatment.The applied to registry data in the context of allogeneic hematopoietic cell transplantation, focusing on the question of which class of immunosuppressants to use so as to prevent and treat the development of the acute graft-vs-host disease to maximize disease-free survival in acute myeloid leukemia patients.I conclude that AFT-BART offers great flexiblility and reduced sensitivity to model misspecification.v ABR ÉG É En pratique clinique, les médecins visent à offrir le meilleur traitement médical aux patients.Cela peut nécessiter une mise au point des traitements ou le choix de différents traitements pour deux patients ayant le même diagnostic, en raison de différences au niveau des caractéristiques des patient.L'utilisation des données afin d'élaborer des règles permettant de personnaliser les stratégies de traitement est connue sous le nom de médecine de précision, ou régimes de traitement dynamiques (RTD), où le traitement ou la recommandation d'un médecin est fondée sur les antécédents du patient (y compris les traitements antérieurs), les facteurs de risque et toute autre information propre au patient qui peut être prise en compte pour adapter les décisions thérapeutiques.Jusqu'à présent, relativement peu de méthodes ont été proposées afin d'estimer les RTD afin d'optimiser les résultats censurés.De toute évidence, des modèles de prédiction flexibles et efficaces sont souhaitables afin de maximiser la précision pour la prédiction de traitements optimaux pour chaque patient, tout en tenant compte des données censurées et des interactions complexes entre les caractéristiques du patient et le traitement.Les arbres additifs de régression bayésienne (AARB) est un cadre attrayant à cet égard, car il peut fournir une décision de traitement simple et interprétable sans connatre la vraie relation paramétrique ou fonctionnelle entre le résultat et le traitement ainsi que le résultat et les covariables.Dans ce mémoire, le AARB est utilisé afin de personnaliser le traitement en supposant une distribution log-normale de temps de défaillance accéléré (TDA) pour le résultat censuré dans un problème clinique en deux étapes.L'approche proposée vi fut comparée par simulation à l'approche bien établie de modélisation paramétrique d'apprentissage-Q.Dans le cas d'une spécification de modèle erronée, l'approche d'apprentissage-Q résulta en une performance médiocre.À l'inverse, le TDA-AARD performa adéquatement et s'améliora en fonction de la taille croissante d'échantillon.Les méthodes ont également été appliquées aux données de registres dans le contexte de la transplantation de cellules hématopoïétiques allogéniques, en mettant l'accent sur la question de quelle classe d'immunosuppresseurs utiliser dans le but de prévenir et traiter le développement de la maladie aiguë du greffon contre l'hôte afin de maximiser la survie sans maladie des patients atteints de leucémie myéloïde aiguë.Je conclus que le TDA-AARD offre une grande flexibilité et une sensibilité réduite aux erreurs dues à la mauvaise spécification de modèles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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