Genetic polymorphisms and antiviral functions of porcine ficolins
Notice bibliographique
Résumé
Collagenous lectins, including ficolins (FCN) and mannan binding lectins (MBL) recognize glycan patterns on microbial surfaces, and single nucleotide polymorphisms (SNPs) that alter MBL expression influence susceptibility to various infectious diseases in humans and pigs. The objectives of this thesis were to characterize interactions of porcine FCN with porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) and to examine the associations of SNPs in FCN and related collagenous lectin genes with susceptibility to PRRSV and other common infectious diseases in pigs. Plasma-purified and recombinant porcine ficolin-[alpha] (FCN-[alpha]) bound to PRRSV particles, neutralized their cytopathic effect and inhibited replication of infectious virions ' in vitro', in a GlcNAc-dependent manner. Fourteen SNPs located in ' MBL's, 'FCN's or 'SP-A' genes and thirteen SNPs located in additional innate immune genes were genotyped in 1283 healthy pigs and 464 pigs diagnosed with common infectious diseases at necropsy using MassARRAY® MALDI-TOF mass spectrometry. Associations with disease diagnoses and with various etiologic agents were evaluated by odds ratio comparisons and a partial least squares (PLS) method of multiple linear regression. When genotype frequencies were compared between diseased and healthy pigs, SNPs found in 'FCN' genes were not significantly associated with disease or etiologic agent. Using a PLS statistical model, the AA genotype of 'FCN'-[alpha] A(671)G was associated with high FCN-[alpha] mRNA expression and decreased risk for K88+ 'E. coli' and porcine circovirus type II (PCV-2) infections. Four SNPs in the 'MBL2' promoter accounted for 41.5% of the variation in hepatic expression of MBL-C mRNA and were associated with enteritis, PCV-2, swine influenza virus (SIV) and 'Mycoplasma' infections. SNPs in 'MBL1' and 'MBL2' accounted for over 40% of the variation in severity of histologically-graded PRRSV-associated pneumonia and the mutant allele of 'MBL2' G(-1081)A was most associated with increased susceptibility to and severity of lung lesions in PRRSV-positive pigs. These studies provide the first evidence for antiviral activity of ficolins but did not find strong associations with disease and polymorphisms in either pig ficolin gene. However, the results suggest that polymorphisms in some collagenous lectins, especially 'MBL2', are markers for susceptibility to pneumonia associated with PRRSV and some other infections in pigs.
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».