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Enregistrement W7057072679

The functional and structural analysis of integrin B|1 by mapping the epitopes of stimulatory mAbs of integrin B|1

2007· other· en· W7057072679 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2007
Typeother
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeMonoclonal antibodyIntegrinAntibodyLinear epitopeEpitope mappingProtein subunitIntegrin alpha M
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In previous studies, a group of monoclonal antibodies were produced against the human $\\beta\\sb1$ subunit and identified as stimulatory antibodies that can up-regulate integrin ligand binding capacity. In this study, epitope mapping of these antibodies was used to identify regions of the $\\beta\\sb1$ subunit involved in this function. To achieve this, a $\\beta\\sb1$ epitope library which was expressed as a fusion protein in an E.coli host strain was generated and screened with a panel of stimulatory antibodies. The epitopes were identified by sequencing the inserts of positive clones to which the antibody reacted. I found that there are two distinct molecular regions influencing up-regulation of $\\beta\\sb1$ integrin mediated attachment. The epitopes of the stimulatory mAbs JB1B, B3B11 and 21C8 are located on the membrane proximal region (648-705aa) of $\\beta\\sb1$ integrin. The epitope of the other stimulatory monoclonal antibody N29 is located on the amino terminal region (1-60aa) of $\\beta\\sb1$ integrin. In the study of functional regulation of $\\beta\\sb3$ integrin, the homologous regions (residue 1-6 and residue 02-690) have been shown to be the sites recognized by stimulatory antibodies to ligand-induced binding sites. This study indicates that there are multiple regulatory regions on the $\\beta\\sb1$ subunit and suggest structural and functional homology between the locations of $\\beta\\sb1$ and $\\beta\\sb3$ regulatory sites. Some functions of integrin are known to be affected by post-translational modification. Through the study of deglycosylation of the $\\beta\\sb1$ native protein, we found that B44, a stimulatory antibody of $\\beta\\sb1$ integrin recognized a carbohydrate epitope or partial carbohydrate epitope. (Abstract shortened by UMI.)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,164
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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