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Enregistrement W7057421043

Human adenovirus type 5 E4orf4 interacts wih the nucleopore component nup205 to regulate viral gene expression and replication

2013· other· en· W7057421043 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2013
Typeother
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésViral replicationGeneViral structural proteinTranscription (linguistics)Transcription factorImmunoprecipitationViral proteinNuclear proteinZinc fingerRNA splicing
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Adenovirus type 5 E4orf4 protein (E4orf4) is a multifunctional protein that regulates viral transcription and splicing. Much of the activity of E4orf4 is thought to be mediated through binding of the Protein Phosphatase 2A (PP2A). E4orf4 recruits target phosphoproteins into complexes with PP2A resulting in dephosphorylation of host factors, such as SR splicing factors and the AP-1 transcription factor. However, the full complement of cellular factors that interact with E4orf4, and the molecular mechanisms that E4orf4 utilizes during replication to regulate gene expression remain poorly understood. In the following study, we utilized immunoprecipitation followed by mass spectrometry to identify novel interacting proteins with E4orf4. Interestingly, we identified a nucleoporin, Nup 205, a component of the nuclear pore complex as an interacting partner. We show that the Arginine Rich Motif (ARM) of E4orf4 is required for interaction with Nup 205 and for nuclear localization of E4orf4. ARMs are commonly found on many viral nuclear proteins. Interestingly, we observed that Nup 205 interacts with three different viral nuclear proteins containing ARMs. In each case, viral ARM proteins also bound to the same region on Nup 205. Point mutations of the ARM sequence on each of the three viral proteins resulted in loss of interaction with Nup 205 and loss of nuclear localization of the viral protein. Nup 205 may therefore represent a common cellular target for viruses encoding ARM containing proteins. We have further tested the role of E4orf4 and Nup 205 in adenovirus replication and gene expression. Previous studies have shown that compared to wild type adenovirus, E4orf4 deficient adenovirus (Orf4-) have elevated E1A and E4orf6 expressions and reduced late protein production. Such effects are phenotypically copied by the loss of Nup 205, where wild type adenovirus infecting H1299 cells with reduced level of Nup 205 also results in elevated E1A and E4orf6 and reduced late protein production. Furthermore, knockdown of Nup 205 resulted in reduced cytopathic effect and a more than four-fold reduction in the replication of wild type adenovirus. Taken together, these data suggest Nup 205 is required by adenovirus for proper regulation of gene expressions and viral replication, and that interaction with E4orf4 may mediate these effects. Since E4orf4 is known to deregulate phosphorylation of its target proteins, our future studies will focus on identifying phosphorylation sites on Nup 205 and determining the effect of E4orf4 on such sites and nucleopore structure and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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