Molecular epidemiology and diagnostics for Echinococcus multilocularis in canid definitive and intermediate hosts
Notice bibliographique
Résumé
Echinococcus multilocularis shed by canid definitive hosts causes alveolar echinococcosis (AE) in rodent intermediate hosts as well as human and dog aberrant hosts. AE is debilitating in humans and dogs, resulting in serious health challenges and expenses for both veterinary and public health. This thesis addresses needs to improve molecular and serological diagnostics for E. multilocularis in wild canids and dogs. I adapted and evaluated an in-house copro-qPCR-MCA which has comparable diagnostic sensitivity and specificity with the ‘gold standard’ adult cestode recovery, and superior diagnostic sensitivity (92% vs 39%) when compared to conventional fecal flotation techniques. I demonstrated E. multilocularis prevalence of 72% in coyotes in Saskatchewan, a highly endemic region, and using the copro-qPCR-MCA, 17% in coyotes from a newly endemic and highly populated area of British Colombia, and 10% in foxes from islands in the western Canadian Arctic. I also demonstrated parasite stage specificity of the Em95 antigen for serological diagnosis of canine AE in coyotes with intestinal infections, suggesting that serology for the Em95 antigen is likely to be an excellent tool for detecting cases of AE in dogs in North America, where this disease is increasingly described. My thesis also described 27 cases of canine AE from western Canada, highlighting important clinical, epidemiological, and economic information for veterinary practitioners and dog owners and indicating that dogs with AE may serve as indicators of parasite range expansion and risk to humans. Finally, molecular epidemiology revealed that the haplotypes present in intestines of wild canids and AE cases in dogs and humans in prairie regions of western Canada are highly pathogenic and zoonotic European strains, compared to the N2 strain previously described in central North America. In the western Canadian Arctic, my thesis reports, for the first time, that the established haplotype of E. multilocularis is N1 North American Arctic strain, and not Asian strains reported from the west coast of Alaska, nor the N2 or European strains established in populated regions of southern Canada. Therefore, the Canadian Arctic remains vulnerable to introduction of Asian and European strains with higher zoonotic potential. This thesis provides useful diagnostic tools for large scale prevalence studies of E. multilocularis in canids, as well as data on the molecular epidemiology and prevalence which can guide the formulation of control and prevention policies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».