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Enregistrement W7058422657

Molecular genetic basis of non-syndromic retinal dystrophies

2013· other· en· W7058422657 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueRadboud Repository (Radboud University) · 2013
Typeother
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthVlaamse regeringNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekStichting Wetenschappelijk Onderzoek OogziekenhuisLandelijke Stichting voor Blinden en SlechtziendenAlgemene Nederlandse Vereniging ter voorkoming van BlindheidOogfondsRadboud UniversiteitFonds Wetenschappelijk OnderzoekMinistero della SaluteInstituto de Salud Carlos IIIZonMw
Mots-clésRetinitis pigmentosaFrameshift mutationDisease gene identificationAlleleExome sequencingRetinal DisorderNonsense mutationRetinalRetinal degeneration
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this thesis was to identify and characterize genetic defects underlying retinal ciliopathies. Initially, genetic defects were detected by homozygosity mapping using high-density genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays in combination with a positional candidate gene approach. After the advent of next generation sequencing technology, the approach shifted to a combination of homozygosity mapping with targeted next generation sequencing, which, finally, was replaced by exome sequencing.\nChapter 2 summarizes all genes, mutations and modifier alleles associated with non-syndromic retinal ciliopathies, the progress that was made in dissecting the associated retinal disease mechanisms, and an evaluation of gene augmentation approaches to antagonize retinal degeneration.\nChapter 3 describes mutation analysis of IQCB1 in 226 individuals affected by Leber congenital amaurosis (LCA). We identified frameshift and nonsense mutations in 12 individuals diagnosed with LCA.\nIn Chapter 4, we performed restriction fragment length polymorphism analysis of the BBS1 p.Met390Arg allele in 2,007 individuals affected by autosomal recessive retinitis pigmentosa (RP). We found a significant association between this BBS1 variant and non-syndromic autosomal recessive RP and relatively mild forms of Bardet-Biedl syndrome (BBS).\nChapter 5A presents C8orf37 as a new gene involved in RP and cone-rod dystrophy. In Chapter 5B the interactome of C8orf37 is described and the role of C8orf37 in photoreceptors is proposed.\nFinally, Chapter 6 is dedicated to the general discussion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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