Preliminary studies for proteomic analysis of dystroglycan associated proteins in the brain
Notice bibliographique
Résumé
Dystroglycan is a ubiquitous protein that links the extracellular matrix to the cytoskeleton and is the central unit of the dystrophin glycoprotein complex (DGC), a membrane complex that connects the cytoskeleton to the extracellular matrix (ECM). Dystroglycan is composed of two subunits that are tightly but non-covalently linked. alpha Dystroglycan (alpha DG) is located extracellularly and it is the only component of the DGC linked to the ECM, while beta Dystroglycan (beta DG) spans the plasma membrane and has both an extracellular and a cytoplasmic domain. The DGC is involved in skeletal muscle maintenance and viability, and in the organization and stabilization of the neuromuscular junction, but its function in brain is poorly understood. DGC components are target of several protein kinases, indicating that they are involved in cell signalling pathways. The finding of new dystroglycan interacting proteins could help to obtain some insights in its function in brain tissues. Previous immunoprecipitation and pull down experiments have been used to identify proteins interacting with the cytoplasmic tail of beta DG in brain tissues. Here, we attempt to extend the use of these techniques by using pull down experiments performed with the Glutathione-S-transferase (GST) fusion expression system as a tool for the proteomic analysis of Dystroglycan interacting proteins in the brain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».