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Enregistrement W7061684168

The role of the glycosyl hydrolase Ega3 in the biology of aspergillus fumigatus

2023· dissertation· en· W7061684168 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Power Generation Technologies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAspergillus fumigatusHydrolaseGlycoside hydrolaseGlycosylEnzyme
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspergillus fumigatus is a ubiquitous environmental mold.When conidia of A. fumigatus are inhaled by immunosuppressed individuals they can germinate to form filamentous hyphae that invade lung tissue to cause a necrotizing pneumonia which is associated with a high mortality rate.One of the major virulence factors of A. fumigatus is the production of the secreted cationic exopolysaccharide galactosaminogalactan (GAG), which is essential for biofilm formation.GAG is predicted to be synthesized by the products of a five gene cluster, one of which, ega3, is predicted to encode a glycoside hydrolase anchored to the cell membrane of A. fumigatus.Through mass spectrometry studies, we established that Ega3 cleaves mature deacetylated GAG.We hypothesized that like the other proteins in the cluster, Ega3 is necessary for GAG synthesis.To test this hypothesis, we sought to disrupt the ega3 by allele replacement with a drug resistance marker and characterize the phenotype of the resulting ega3 null mutant.Initial attempts to disrupt ega3 by our usual approach were unsuccessful but two ega3 null mutants were finally recovered, one using CRISPR/Cas9 and another using the conventional split marker protocol.Like other mutants in the GAG cluster, these mutants were deficient in biofilm formation and did not produce deacetylated GAG.Surprisingly, complementation with an ega3 allele failed to restore biofilm formation in both strains, despite restoration of Ega3 protein production as demonstrated by Western blot.These findings were consistent with the presence of a secondary mutation impairing GAG production.Analysis of the expression of the GAG cluster genes revealed that agd3, encoding the GAG deacetylase required for the production of mature, cationic GAG, was not expressed in the ega3 CRISPR mutant.Genome sequencing revealed that uge3, required for GAG production, was mutated in the other ega3 null mutant.Since we were only able to disrupt ega3 in the absence of the production of cationic GAG, we hypothesized that ega3 is conditionally essential in the presence of cationic GAG.To test this hypothesis, agd3 was expressed in the ega3 CRISPR mutant under the control of a tetracycline-inducible promoter (ega3 CRISPR ::agd3 Tet on ).Under agd3expressing conditions, GAG production was restored but fungal growth was inhibited.Since GAG is a large cationic polymer and Ega3 cleaves cationic GAG, we hypothesized that cationic GAG may be toxic to the cell membrane of A. fumigatus and that membrane-bound Ega3 degrades GAG near the membrane.To test whether cationic GAG induces damage to the cell membrane in the absence of Ega3, ATP was measured in fungal culture supernatants as a proxy for cell leakage.Induction of agd3 expression in the ega3 CRISPR ::agd3 Tet on mutant resulted in the release of high levels of ATP suggesting that cationic GAG disrupts the cell membrane of A. fumigatus.We therefore hypothesized that secreted GAG may also mediate host cell injury during infection.To test this hypothesis, A549 pulmonary epithelial cells were loaded with radioactive chromium and exposed to culture supernatants from wild-

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,415
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle