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Enregistrement W7061966036

SHP-1/PTP-1B Macrophage interactome upon «Leishmania mexicana» infection

2012· other· en· W7061966036 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2012
Typeother
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdaptive optics and wavefront sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeishmaniaMacrophageInteractomeCytoplasmTranslation (biology)Protein tyrosine phosphataseCellHost (biology)Parasite hosting
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leishmaniasis is a disease endemic to 88 countries that affects 12 million people worldwide. The causative agents are species of the genus Leishmania, with the clinical manifestation of this disease depending on the species. Once in the host, the parasite lives inside various cell types including macrophages, and must modulate the host cell functions to survive. Host macrophages are capable of detecting various foreign molecules and mounting cellular responses. Macrophages engulf their target pathogen and, through the maturation of the phagolysosome, will destroy it. To prevent aberrant activation of the cell, macrophages use protein tyrosine phosphatases (PTPs) to return activation signals (i.e. phosphorylation) in signalling pathways to their resting state. Leishmania employs multiple strategies to alter the host signalling and functions. One such mechanism is the ability of the parasite to activate host PTPs by proteolytic cleavage. In this study, we isolated the plasma membrane and the cytoplasm of macrophages to identify the localization of and alteration in host PTPs, PTP-1B and SHP-1 during infection with Leishmania mexicana. We observed that during an infection, cleaved SHP-1 is no longer found at the plasma membrane. Prior to an infection, we also noted that the proportion of PTP-1B and SHP-1 located in the plasma membrane is minute compared to the amount found in the cytoplasm. The second part of the study was to compare the interactomes of PTP-1B and SHP-1 in resting cells and during an infection. We noticed distinct groups of proteins interacted with these PTPs, including proteins involved in translation and RNA manipulation, cell metabolism, and subcellular localization. We also observed large variations in the level of interaction with the interactants and the PTPs. This study demonstrates Leishmania refined ability to control the host cell to prevent its destruction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,157
Écart entre enseignants0,153 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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