Anatoxin-producing and non-toxic strains of Microcoleus sp. coexist in benthic cyanobacterial mats in the Wolastoq (Saint John River, Canada)
Notice bibliographique
Résumé
The presence of toxigenic benthic cyanobacteria in riverine ecosystems is an increasing concern around the world. In 2018, the death of three dogs along the Wolastoq in New Brunswick, Canada, was attributed to anatoxin exposure after they ingested benthic microbial mats found along the shore. Four samples of the material ingested by the dogs and from the vicinity were collected. Then, 15 non-axenic cyanobacterial isolates were obtained from the same material. Total DNA of the 19 samples was sequenced using Illumina technology. Metagenomic assemblies recovered near-complete Microcoleus genomes from 12 of the sequenced samples. The high average genomic sequence similarity (>95% identity at the nucleotide level) suggests that the 12 genomes are representatives of the same “genomic” Microcoleus species. The genetic repertoire to produce anatoxin-a and dihydroanatoxin-a was identified in 9 of these genomes. The capacity for anatoxin production was confirmed by LC-MS. The overall comparison revealed that genomes of the 9 toxigenic Microcoleus isolates contain a higher number of accessory genes than their 3 non-toxigenic relatives. These differences suggest that toxigenic Microcoleus variants from the Wolastoq would be more responsive to changing environments, nutrient limitation and/or bacteriophage infection. Our results suggest that the two Microcoleus strains inhabited the original benthic mats in similar relative abundances.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».