The Association of Polymorphisms in Interleukin-6 (IL-6), Interleukin-10 (IL-10), IL-6 Receptor, and IL-10 Receptor Genes with the Risk of Pediatric Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
Paulina Krawiec,1 Monika Lejman,2 Elżbieta Pac-Kożuchowska1 1Department of Pediatrics and Gastroenterology, Medical University of Lublin, Lublin, 20-059, Poland; 2Independent Laboratory of Genetic Diagnostics, Medical University of Lublin, Lublin, 20-059, PolandCorrespondence: Paulina Krawiec, Department of Pediatrics and Gastroenterology, Medical University of Lublin, Racławickie 1, Lublin, 20-059, Poland, Tel +48817185420, Email paulina.krawiec@umlub.plPurpose: Inflammatory bowel disease (IBD) results from a complex interplay between genetic, immune, and environmental factors. Despite a significant advancement in genetic studies, until now, little is known about genotype–phenotype correlations in children with IBD. Thus, we aimed to evaluate if polymorphisms in the Interleukin-6 (IL-6), Interleukin-10 (IL-10), IL-6 receptor, and IL-10 receptor genes are associated with the risk for pediatric IBD, its phenotype and severity.Patients and Methods: We enrolled 50 children with IBD in the study group and 20 healthy children to the control group. Demographic and clinical data of the subjects were collected from available electronic medical records. The DNA was extracted from peripheral blood samples of all individuals. TaqMan® single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping assays were used to detect IL-10 variants RS3024505 and RS1800872, IL-10RA RS3135932, IL-10RB RS2834167, IL-6 RS10499563, and IL-6R RS4537545. A binary logistic regression model was used to evaluate the association between SNP’s and the risk of IBD, IBD onset, phenotype, and the need to use of steroids or biologics.Results: There was a significant difference in the genotype distribution of IL-6 RS10499563 between patients with IBD and control group (χ 2 = 10.96, p = 0.004). The distribution of genotype CT at IL-6 RS10499563 was higher, whereas the distribution of genotype CC and TT at IL-6 RS10499563 was lower in children compared to controls. There were no significant differences in the distribution of the other SNPs between the study and control groups. We found a significant association between the genotype CT at IL-6 RS10499563 and the risk of ulcerative colitis (OR 13.41; 95% CI: 1.58– 114.26; p = 0.02), but not Crohn’s disease (OR 7.60; 95% CI: 0.82– 70.16; p = 0.07).Conclusion: In this study, we found a significant association between the genotype CT at IL-6 RS10499563 and the risk of ulcerative colitis in children.Keywords: Crohn’s disease, ulcerative colitis, children, genetics
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».