Catching Rabies by the Toe:: An Investigation into the Toehold Switch as a Sensor for Rabies virus
Notice bibliographique
Résumé
Rabies is a disease of the central nervous system caused by the Rabies virus. Current methods to test for Rabies are costly, time consuming, and not sensitive enough to identify the disease early enough for treatment. A novel mechanism of virus identification that has shown promise for Ebola and Zika virus detection is the toehold switch. Toehold switches are RNA-based constructs that allow the visual identification of genomic targets of interest. They are composed of a switch RNA and a trigger RNA. In the presence of the trigger, a change in secondary structure causes the reporter gene following the switch to be expressed. When the trigger is not\npresent, the gene is repressed. This project designed a toehold switch for use as a Rabies virus sensor. First, a region of the Rabies genome was identified as a promising trigger sequence. From this sequence, a complementary switch was designed with GFP as a reporter gene. The designed switch was constructed and inserted into a pBluescript plasmid backbone. The next steps of this project would be to develop an assay to test the effectiveness of the switch to identify Rabies virus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».