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Enregistrement W7064778088

Characterization of Glutathione-S-transferase from Toxin-Resistant Gastropod Tritonia diomedea

2016· dissertation· en· W7064778088 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueCSUN ScholarWorks (California State University, Northridge) · 2016
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesProgram for Education and Research in Biotechnology, California State UniversityCalifornia State University, East BayGolden Key International Honour Society
Mots-clésMarine invertebratesDetoxification (alternative medicine)EnzymeGlutathioneInvertebrate
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutathione-S-transferase (GST) is an important phase II detoxification enzyme, which fuses an electrophilic substrate with glutathione (Blanchette, Feng, & Singh, 2007). The conjugation products, with rare exceptions, are more polar, less toxic, and more readily excreted than their parent compounds (Hodgson & Rose, 2010). Most animals have several GST forms to act upon a variety of substrates (Blanchette et al., 2007). Tritonia diomedea is a marine gastropod which lives in sub-tidal waters along the Pacific West coast. This species is also known as Tritonia tetraquetra (Martynov, 2009). T. diomedea is an interesting invertebrate model due to its ability to feed on the toxic sea pen Ptilosarcus gurneyi. The compound ptilosarcenone has been isolated and characterized from this sea pen (Hendrickson & Cardellina, 1986). In order to handle the menace from toxic compounds, it is possible that the marine gastropod T. diomedea possesses a unique detoxification system to facilitate the excretion of toxic compounds such as ptilosarcenone.
\nMy master???s thesis project is about the isolation and purification of GST in the marine gastropod T. diomedea. The gastropods were collected via SCUBA close to Tofino (British Columbia, Canada) and Dash Point (Washington, USA). Digestive glands were chosen as tissue source as they house detoxification enzymes and accumulate heavy metals and other toxins. Ptilosarcenone was purified from sea pen tissue by Dr. Taro Amagata, a Chemistry Professor from San Francisco State University.
\nAfter extraction and purification of GSTs via affinity chromatography, I quantified protein content and measured GST activity. Upon optimizing the assay conditions for the samples, I discovered that 2.4 mM 1-chloro-2,4-dinitrobenzene (CDNB) and 10 mM glutathione (GSH) yielded optimum activity at pH 7.5. Further kinetic analysis revealed substrate inhibition for CDNB, but not GSH. The Km values for the substrate GSH range from 1.10 mM to 1.73 mM when experiments were conducted with crude extracts. With the optimized assay conditions specific GST activity values for Dash Point samples were on average 4-times greater than for Tofino samples. SDS-PAGE analysis (Coomassie blue and silver staining) showed one major GST isoform with a molecular weight of ~25 kDa.
\nBesides the universal substrate CDNB, other more specific alternative substrates such as 1,2-dichloro-4-nitrobenzne (DCNB), p-nitrobenzyl chloride (pNBC), and ethacrynic acid were tested. However, none of the alternative substrates showed any appreciable activity. The effect of ptilosarcenone on the NIH-3T3 L1 cells and on the GST activity remained unclear due to the limited solubility of ptilosarcenone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,562
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0460,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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