Cloning and expression of a cunner-fish trypsin in bacteria and yeast
Notice bibliographique
Résumé
Many proteins with special properties have been identified in aquatic organisms. Due to their peculiarity, some of these biomolecules could be used advantageously for some industrial and health care applications. However, the preparation of these biochemicals from its original source is highly impractical and generally unfeasible for commercial purposes. Nevertheless, the advances in DNA manipulation open the possibility of producing the recombinant proteins in different organisms to allow a viable production and extraction on a commercial scale. Among such particular proteins, the cunner-fish trypsin (CFT) is an enzyme with a high potential for exploitation by the food processing industry. The CFT is a cold adapted protease that has a proven ability to inactivate undesirable endogenous enzymes during the processing of some foodstuffs. Thus, the CFT gene was characterized and cloned in E. coli and Pichia pastoris for over-expression. A cDNA library from pancreatic mRNA was screened using a salmon trypsin cDNA probe. Positive clones harboring a cDNA insert of the predicted size were sequenced and a full-length cDNA was obtained that contained an ORF encoding the zymogen and a signal peptide. Multiple alignment of the gene sequence showed 85 to 90 per cent identities with other fish trypsins and the deduced amino acid sequence for the mature enzyme exhibited the entire characteristic features observed in trypsins. E. coli expressed the recombinant CFT (rCFT) at levels higher than 20% in the form of insoluble aggregates, while P. pastoris showed expression levels below 1%. Despite the low expression, the yeast rCFT appeared to be correctly folded and could be partially purified by immobilized nickel affinity chromatography. Trypsin-specific activity was confirmed in the purified rCFT after digestion with bovine enterokinase.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».