Endofüütsed bakterid Eestis kasvatatavates juurviljades
Notice bibliographique
Résumé
Antud töös uuriti viie Eestis kasvatatava juurvilja koore ja sisu bakterite kooslusi ning optimeeriti katsesüsteemi, eesmärgiga saavutada esinduslik valim juurviljade endofüütsete bakterite liigirikkusest. Selleks kasutati kahte erinevat DNA eraldamismeetodit ja bakterite identifitseerimiseks amplifitseeriti PCR 16S rDNA V4 hüpervariaabel regiooni, mis sekveneeriti Illumina MiSeq tehnoloogiaga. Kahe erineva DNA eraldamismeetodiga õnnestus samadest proovidest identifitseerida olulisel määral erinevad bakteriliigid. Analüüs näitas, et juurviljade koore endofüütsete bakterite kooslused on mitmekesisemad, kui sisu omad. Kõikide juurviljade koores kui ka sisus domineerisid Gammaproteobacteria esindajad. Koores oli rohkem Alpahaproteobacteria, Actinobacteria, Betaproteobacteria ja Bacteroidetese esindajaid. Sisus oli lisaks gammaproteobakteritele ka klass Bacilli esindajaid. Tööst selgus, et juurviljade mirkobioom on väga mitmekesine ja oluline on jätkata nende edasist uurimist.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».