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Enregistrement W7065967890

Functional studies of MEIS1, a HOX co-factor

2007· dissertation· en· W7065967890 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2007
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAstrophysical Phenomena and Observations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTransactivationChromatin immunoprecipitationTranscription factorCREBHomeoboxTranscription (linguistics)Hox geneCREB-binding proteinRepressor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HOX proteins are evolutionarily conserved homeodomain-containing transcription factors involved in hematopoiesis and patterning during embryogenesis. Their tasks as master regulators of embryonic development are achieved in large part through their ability to interact with co-factors of the PBX and MEIS/PREP families, which constitute the broader three amino-acid loop extension (TALE) class of homeodomain proteins. HOX, MEIS, and PBX have been implicated in leukemic hematopoiesis due to their association with hematological malignancies. The oncogenic function of MEIS1 in accelerating the onset of acute myeloid leukemia induced by HOX was mapped to its C-terminal transactivation domain, which is responsive to PKA signaling. This thesis extends our understanding regarding the mechanism by which MEIS1A executes its C-terminal transactivation function in vivo. We describe the involvement of CREB and its co-activators CBP and TORC in conferring the PKA-responsiveness of the ME1S1A C terminus. CREB mutants that fail to bind CBP or TORC also fail to promote PKA induction mediated by the C terminus of ME1S1A. TORC was further shown to be capable of bypassing the need for PKA to activate transcription by MEIS1, an ability endowed by its physical interaction with MEIS1. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) demonstrated a concerted recruitment of endogenous MEIS1, TORC2, and CREB proteins on ME1S1 target genes. In addition, this thesis also characterizes the promoter of the murine Meis1 gene. Meis1 possesses multiple transcription start sites upstream of its translation initiation site. We identified a ME1S·PBX consensus recognition site within the Meis1 promoter and showed that PBX1 binds to this sequence in vitro. Our ChIP assay results further suggest an autoregulatory mode for the Meis1 gene as revealed by a co-occupancy of endogenous CREB, TORC2, PBX1, and MEIS1 itself on the Meis1 promoter. Collectively, this thesis proposes a mechanistic action conferred by CREB, CBP and TORC in the PKA-inducible transactivation of ME1S1A, and provides new information on the Meis1 promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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