Genetic Dissection of Virulence and Immune-eliciting Functions and Characterization of the Immune Response of the Pseudomonas syringae HopZ1 Type III Effector Family
Notice bibliographique
Résumé
Successful pathogens like Pseudomonas syringae translocate type III effector proteins (T3SE) into host cells. Plant hosts react by specifically recognizing these effectors via R proteins that trigger defense responses. The T3SE family HopZ1 has evolved into three allelic forms as a result of diversifying selection. In this thesis, I investigated how virulence and immune-eliciting functions are determined in HopZ1a and HopZ1b in Arabidopsis. Mutational analysis of HopZ1a identified ten residues important for immune elicitation and at least three are involved in virulence functions. These results suggest that distinct key amino acid residues in HopZ1a mediate the two activities. The closely related HopZ1b T3SE elicits an inconsistent immune response in Arabidopsis. We found that HopZ1b-triggered immune response involves a TIR-type R protein and plastid-derived SA. Together, these results highlight an uncharacterized ETI response to the HopZ1 family of T3SEs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».