Food animal reservoir for extraintestinal pathogenic «Escherichia coli» causing human infections
Notice bibliographique
Résumé
Studies of extraintestinal infections caused by genetically related strains of Escherichia coli among unrelated people have demonstrated the epidemic potential of this group of bacteria. These related extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) may have a common source. Our group recently described how retail meat, particularly chicken, may be a reservoir for ExPEC causing human urinary tract infections (UTIs). By moving upstream on the farm to fork continuum, this study tests whether the reservoir for ExPEC is in food animals themselves. A total of 824 geographically and temporally matched E. coli isolates from cecal contents of slaughtered food animals (n=349) and human UTI (n=475) sources were compared. Using 6 different typing methods, an evolutionary relationship was observed between E. coli isolates from the food animal reservoir and human UTI. Moreover, chicken was the predominant animal species from where the related isolates originated. Using an evolutionary model, chicken was determined to be the most likely source of the human UTI isolates. This study confirmed that an animal reservoir, principally in chicken, may exist for ExPEC causing community-acquired UTI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».