Impacts of Myeloid and Lymphoid Clonal Hematopoiesis on Risks and Outcomes of Critical COVID-19
Notice bibliographique
Résumé
Despite recent advances in the pathogenic understanding of coronavirus disease 2019 (COVID- 19), the full spectrum of risk factors for severe disease remains uncertain. The phenomenon of clonal hematopoiesis (CH), caused by somatic mutations in hematopoietic stem cells, is associated with impaired immune function and cardiopulmonary disease risks. Demographic and inflammatory similarities between CH and COVID-19 suggest that it may predispose to critical illness. Differential roles of common, myeloid CH drivers (M-CH) and unconventional lymphoid forms of CH (L-CH) have been suggested to influence the clinical severity of COVID-19, but the prevalence of these variant types has not yet been compared among affected patients. We therefore hypothesized that CH is associated with risks and outcomes of critical COVID-19, and these associations are influenced by distinct CH subtypes. We identified M- and L-CH variants in a Canadian cohort of critically ill COVID-19 patients using whole-genome and targeted sequencing of peripheral blood samples. We compared the prevalence of the different forms of CH to previously published estimates in multinational populations; and performed targeted sequencing with peripheral blood samples of age-matched controls recruited from similar communities as the COVID-19 cohort. We additionally compared laboratory parameters and clinical outcomes between COVID-19 patients with and without CH. We found that both M- and L-CH are prevalent in critical COVID-19 and appeared to be overrepresented among patients over 50 years of age compared to matched controls, suggesting that these variants are under-recognized risk factors for critical illness. However, CH may hold limited prognostic value after admission to the intensive care unit, as it was not significantly associated with critical COVID-19 outcomes. Future work will aim to expand upon our observations using larger cohorts of patients with critical and non- critical forms of COVID-19; and confirm whether commonly mutated CH genes are causally associated with COVID-19 severity through inflammatory, interferon, or adaptive immune pathways. Ultimately, it is hoped that this research will enhance understanding of the pathogenesis of critical COVID-19 and inform innovative, personalized approaches to its risk stratification and management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».