Implications of Histone Deacetylases in Developmental Disorders
Notice bibliographique
Résumé
Epigenetics play a critical role in regulating gene expression.Many proteins with a wide range of different functions and subcellular localizations play a role in epigenetics.Epigenetic modifications on DNA or histones can impact gene expression, and the epigenetic landscape changes constantly.Known modifications include phosphorylation, acetylation, methylation, ubiquitination, succinylation, crotonylation, propionolyation and sumoylation among others.Several groups in the early 1990s conducted the first studies which established a link between acetylated core histones and transcriptionally active genes.The acetyl group is attached to lysine residues on histones by histone acetyltransferases (HATs) and removed by histone deacetylases (HDACs).It was previously thought that highly acetylated histones cause the chromatin to be in a looser configuration due to the removal of the positive charge on lysine residues of histone tails.This modification allows the DNA to be more accessible to transcription factors whilst low levels of histone acetylation are associated with more condensed DNA and a transcriptionally repressed state, resulting from the stronger interaction between the positively charged lysine tails on histones and the negatively charged DNA backbone.The current understanding of acetylation and epigenetic regulation is more complex, with "writers", "readers", and "erasers" interacting in conjunction to interpret specific epigenetic marks and subsequently affect gene expression.In humans, there are many known acetylases and deacetylases but how mutations in these genes cause genetic diseases in humans remains unanswered.In this project, we explored histone deacetylase 3 (HDAC3) in complex with silencing mediator for retinoid and thyroid receptor (SMRT) and the other associated proteins.HDAC3 is a class I HDAC and is one of the proteins that regulate the VII
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».