Identification of a Carboxysomal γ-Carbonic Anhydrase in the Mesophilic Cyanobacterium Anabaena sp. PCC7120
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Analysis of the genome of Anabaena sp. PCC7120 reveals that it lacks the gene, ccaA, which encodes the bonafide carboxysomal, β-class carbonic anhydrase (CA) CcaA. However, the carboxysome enriched fraction of Anabaena PCC7120 exhibits CA activity. Bioinformatic analysis reveals that the N-terminal region of the carboxysome protein CcmM has high sequence and structural similarity to the γ-class CA of Methanosarcina thermophila. Recombinantly expressed CcmM is found to be inactive in in-vitro CA assays. E. coli cell extracts containing an overexpressed form of CcmM comprised of the N-terminal 209 amino acids (CcmM209) are also inactive. However, CcmM209 displays CA activity after incubation with the thiol oxidizing agent diamide or when bound to an affinity matrix. It appears that CcmM is indeed a functional γ-CA which is active under oxidizing condition. It is hypothesized that the C-terminal RbcS like domain in CcmM may regulate activity by allowing CcmM activation only when sequestered within the carboxysome.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle