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Enregistrement W7066557077

Identification of a Carboxysomal γ-Carbonic Anhydrase in the Mesophilic Cyanobacterium Anabaena sp. PCC7120

2010· dissertation· en· W7066557077 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnabaenaEnzymePeptide sequenceThioredoxinMethanosarcina barkeriEscherichia coliCysteinePhosphofructokinase 2
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Analysis of the genome of Anabaena sp. PCC7120 reveals that it lacks the gene, ccaA, which encodes the bonafide carboxysomal, β-class carbonic anhydrase (CA) CcaA. However, the carboxysome enriched fraction of Anabaena PCC7120 exhibits CA activity. Bioinformatic analysis reveals that the N-terminal region of the carboxysome protein CcmM has high sequence and structural similarity to the γ-class CA of Methanosarcina thermophila. Recombinantly expressed CcmM is found to be inactive in in-vitro CA assays. E. coli cell extracts containing an overexpressed form of CcmM comprised of the N-terminal 209 amino acids (CcmM209) are also inactive. However, CcmM209 displays CA activity after incubation with the thiol oxidizing agent diamide or when bound to an affinity matrix. It appears that CcmM is indeed a functional γ-CA which is active under oxidizing condition. It is hypothesized that the C-terminal RbcS like domain in CcmM may regulate activity by allowing CcmM activation only when sequestered within the carboxysome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,907

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,152
Écart entre enseignants0,150 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle