Infection outcomes under genetic and environmental variation in a host-parasite system: Implications for maintenance of polymorphism and the evolution of virulence
Notice bibliographique
Résumé
Virulence (the harm to the host during infection) is the outcome of continuous coevolution between hosts and parasites. This thesis adds to a growing body of work on host-parasite interactions, and describes experiments that study the effects of variation in the genetic and the environmental contexts of infection. All of them focus on interaction between the planktonic freshwater crustacean Daphnia magna and a naturally occurring parasite, the spore-forming bacterium Pasteuria ramosa. I show that elevated minimum temperatures that facilitate parasite growth drive natural epidemics of this parasite. I also demonstrate that the expression of infection traits in P. ramosa is temperature-dependent in a genotype-specific manner [genotype-by-environment (GxE) interactions]. These GxE interactions could maintain polymorphism through environment-dependent selection. Next, I test if GxG interactions for infectivity can be altered by environmental variation (GxGxE interactions), and find that this trait is quite robust to thermal variation. Infectivity is also more important in determining parasite fitness relative to the production of transmission stages, highlighting the importance of considering natural infection routes, an aspect sometimes overlooked in studies of host-parasite systems. Another experiment under different food and temperature regimes showed evidence for environment-dependent virulence-transmission relationships, a fundamental component of virulence evolution models. Lastly, I show that variation in temperature does not increase the cost to the host of resisting infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».