Investigation of the Immunogenicity and Specificity of the Transferrin Binding Proteins from Bovine Pathogenic Bacteria
Notice bibliographique
Résumé
Through trying to survive and proliferate within their hosts, pathogens have developed creative mechanisms of acquiring iron. A nutrient required for survival by most organisms, iron is both highly sought and jealously guarded. Hosts sequester iron using iron-binding proteins. These iron sinks keep the extracellular concentration of free iron at a level that does not support microbial proliferation. Transferrin is a bilobal iron carrying protein found in the blood and cerebrospinal fluid, and on mucosal surfaces. It is targeted by a number of microbial transferrin binding proteins and siderophores. This thesis focuses on one of the best-studied bacterial transferrin receptors, which consists of the transporter TbpA and its associated surface lipoprotein TbpB. TbpA and TbpB have been studied for years as potential vaccine antigens. Recently, mutants of TbpB that do not bind transferrin have been shown to provide improved protection against infection compared to wild-type TbpB. In this thesis, I develop a method for rapidly screening TbpB mutants, measure loss of affinity for multiple mutations, and investigate the effectiveness of a mutant in generating transferrin blocking antibodies. Furthermore, I investigate multiple methods of measuring binding specificity in Tbp-transferrin interactions in order to lay the groundwork for identifying functionally important residues in Tbps, and for designing improved animal models of infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».