Mechanistic Insights into the Notch signalling pathway through Molecular Condensation
Notice bibliographique
Résumé
The ability of a cell to undergo cellular decisions is ingrained in the integration of cues from its local environments. One such cue is relaying information based on local cell density, neighbouring cell identity, and cell positional information. A key signalling pathway in interpreting this information is the Notch signalling pathway. It is currently poorly understood how Notch is able to play a titratable role in signal transduction as our current model does not effectively translate how fluctuations in Notch signalling lead to dynamic changes in Notch target gene expression. One potential mechanism that has recently been shown to play a role in titratable gene expression of several signalling pathways is the ability for proteins to undergo molecular condensation within living cells. To date, Notch signalling has been difficult to study because of the lack of live cell systems that allow us to study both Notch protein localization and Notch target gene expression in real-time. Using PlayBack, a system I developed that allows for cost-effective plasmid cloning, I was able to develop both a light controlled Notch construct, OptoNotch, and a Live Notch target gene promoter reporter, called Hes1-Live-RNA, to allow for both the visualization and quantification of Notch activity within living cells. Using these tools, I discovered that the Notch 1 intracellular domain forms molecular condensates which in turn positively facilitates both Notch1 target gene expression as well as facilitating Notch’s ability to regulate enhancer looping. This is the first instance of N1ICD undergoing condensation within live cells and offers a mechanism by which Notch can have a titratable effect on target gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».