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Enregistrement W7067681880

Measures of Immune System Status in Young-of-the-Year Winter Flounder (Pseudopleuronectes americanus) from Long Island Coastal Bays

2012· dissertation· en· W7067681880 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueSUNY Digital Repository Support (State University of New York System) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVibrio anguillarumFlounderImmune systemAntimicrobialWinter flounderAquatic animalMucusOyster
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The immune status of YOY winter flounder was evaluated in fish collected from six areas around Long Island, including Jamaica Bay, Little Neck Bay, Manhasset Bay, Oyster Bay, Port Jefferson, and Shinnecock Bay; sites geographically distributed from west to east, representing a large gradient in urbanization, and thus likely contaminant inputs from the water shed. Fish were collected from June to October, and expression of pleurocidin, a gene coding for an antimicrobial peptide found in skin mucus, as well as antimicrobial activity of skin mucus assessed in individual fish from each site. Cytochrome P4501A (CYP1A) expression was also measured as an indicator of contaminant exposure in these fish. Gene expression was quantified using qRT-PCR, and antimicrobial activity was assessed using a growth assay with Vibrio anguillarum and V. parahaemolyticus, two common marine bacteria known to affect winter flounder. Pleurocidin expression was ten times higher in fin tissue than in liver tissue, was highly variable between individual fish, and demonstrated no clear site specific differences associated with degree of urbanization of the watershed. Expression seemed to be related in part to fish size: a positive correlation between expression and total length of fish was observed, and fish in the largest size class (>125 mm TL) demonstrating significantly elevated expression as compared to fish in the smaller size class levels indicating that immune competency increases with age. Antimicrobial activity was also highly variable, showing no large site specific differences, and no significant correlation to pleurocidin expression. No differences in CYP1A expression were observed. These data suggest that exposure to aromatic hydrocarbon contaminants is fairly wide-spread throughout the study area and that any difference in pleurocidin expression in YOY winter flounder observed are due to other factors. The lack of correlation between pleurocidin expression and antimicrobial activity indicates that other antimicrobial peptides may be involved or that other factors are influencing antimicrobial activity. This is to my knowledge the first reports quantitatively evaluating pleurocidin expression in YOY winter flounder from an urban area. Further work is needed to characterize factors controlling pleurocidin expression, as well as other indicators of immune response in young fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,184
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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