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Enregistrement W7067945567

Molecular cloning, functional analysis, and RNA expression analysis of zfCx45.6 : a zebrafish cardiovascular connexin

2003· dissertation· en· W7067945567 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2003
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensBibliothèque et Archives nationales du Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConnexinZebrafishGap junctionConnexonMessenger RNAIn situ hybridizationAmino acidNorthern blotGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gap junctions are intercellular channels that allow the direct exchange of molecules up to about 1200 Daltons in size.Six connexins join together to form a hemichannel termed a connexon, and two connexons from different cells dock to form an aqueous channel.A gap junction is formed by the aggregation of hundreds of these channels into plaques.Gap junctions fuirction in a variety of biological processes such as tissue homeostasis, embryonic development, and tumorigenesis.In the verlebrate cardiovascular system, gap junctions function in intercellular communication essential for the co-ordinated propagation of the heartbeat, and the control of vasomotor responses in the vascular system.In this study, a connexin gene encoding a polypeptide of 400 amino acids, with a molecular weight of 45.6 kDa, was cloned from zebrafish genomic DNA.Accordingly, tlre connexin was named zfCx45.6.ZfCx45.6 exhibits 53Yo amino acid identity to chick Cx42 which is expressed in the cardiovascular system.With the use of the LN54 radiation hybrid panel, zfCx45.6 was mapped to zebrafish linkage group 9. Northern blots and RT-PCR revealed the presence of zfCx45.6 mRNA in the embryo before2 lrours post fertilization (hpf), and then againbeginning at about 12hpf, after which time no major changes in expression levels were detected.In the adult, zfCx45.6 6RNA continued to be detected in the heart, as well as the brain, liver and ovary, but not the lens.Whole mount in-situ hybridization revealed zfCx45.6 mRNA r,vas highly expressed in the major vasculature of the entire embryo, and to a lesser extent in the heart.The zebrafish (Danio rerio) is an excellent model system to study cardiovascular developrnent, in part due to its large, externally developing, optically transparent elnbryos, and the fact that early development can occur in the absence of functional circulation.With the previous isolation of zebrafish Cx43 and Cx43.4,zebrafishorthologues have now been isolated for tluee of the four comexins expressed in the mammalian cardiovascular system.With the advent of antisense technologies and methods allowing for the measurement of many cardiovascular functions in minute anitnals and embryos, these studies lay the groundwork for future studies on the role of connexins in the developing and mature vertebrate cardiovascular system using the zebrahsh model system.as a student in his lab.Witli his advice and support I have learned a great deal over the last few years.I would also like to thank the other members of rny thesis committee, Elissavet Kardami and Ross McGowan, for their insight and suggestions.Thanks to all the students who have been in (and through) the lab, especially Slraohong andLiz' Their comments and discussions, whether related to lab material or not, tnade working in the lab a thoroughly enjoyable experience.Special thanks to Roxane for the weekly meetings.Most of all, I would like to thank rny friends, farnily and loved ones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
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