Molecular phylogeny of Dictyosporium and allied genera inferred from ribosomal DNA
Notice bibliographique
Résumé
The relationships among mitosporic fungi with cheiroid conidia in the genera Cheiromoniliophora, Dictyosporium, Kamatia and Pseudodictyosporium were investigated using sequences of small ribosomal subunit (SSU), internal transcribed spacer regions (ITS) and the 5′ portion of the large ribosomal subunit (LSU) of RNA. Six new SSU sequences were determined and analysed together with related sequences from GenBank using parsimony and Bayesian analyses. A second alignment with 15 ITS and seven partial LSU sequence of rDNA for an expanded set of taxa was also analysed to determine the relationships among various species and genera. Results indicated that the 'Dictyosporium' lineage of mitosporic fungi producing cheiroid conidia are closely related to one another and they form a strong monophyletic group in the Pleosporales. Dictyosporium appeared to be paraphyletic but its monophyly could not be ruled out. Most Dictyosporium species belonged in one of two lineages that correlated imperfectly with conidial shape and the number of conidial arms. The systematic positions of Dictyosporium australiense and D. toruloides were not fully resolved. The phylogenetic position of Digitodesmium was within Dictyosporium, although without statistical support. Cheiromoniliophora elegans, Kamatia indica and Pseudodictyosporium wauense were close relatives and formed a monophyletic clade divergent from species of Dictyosporium. Most morphological characters used to delineate genera and species correctly predicted phylogenetic relationships.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».