Molecular Dynamics Based Predictions of the Structural and Functional Effects of Disease Causing Cardiac Troponin C Mutations
Notice bibliographique
Résumé
Human cardiac troponin C (HcTnC), the regulatory calcium-binding component of the troponin complex, is responsible for the regulation of cardiac muscle contraction in response to varying cytosolic calcium levels. Mutations that are shown to increase the cTnC Ca2+ affinity are hypothesized to induce hypertrophic cardiomyopathies (HCM). Several mutations in HcTnC have been selected that are associated with HCM. These mutations include A8V, L29Q, C84Y, E134D, and D145E. The structural effects of these mutations have been modeled through equilibrium molecular dynamics and their functional and structural impacts have been assessed. In each mutant that was analyzed, the equilibrated structures have shown notable deviations from wild-type in the regions known to be cardiac troponin I (cTnI) interaction sites. There were differences in the conformation dynamics of site II and cTnC/cTnI interaction sites. We anticipate these correlations may contribute to Ca2+ affinity either directly or indirectly through cTnI association.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».