Structure-function analysis of a mitochondrial cell death protein, Bcl-2/E1B 19K interacting protein 3 (BNip3)
Notice bibliographique
Résumé
BNip3 resembles Bcl-2-related proteins, based on sequence similarity to the Bcl-2 homology 3 (BH3) domain and COON-terminal transmembrane (TM) domain. Characteristically, the 'BH3-only' class of Bcl-2 proteins heterodimerize with Bcl-2/Bcl-xL and induce cell death through their BH3 domain. BNip3 and its 'C. elegans' orthologue, CeBNip3 interact with cell death repressors Bcl-2, Bcl-xL and CED-9 in yeast and mammalian expression systems. Unlike other BH3-only agonists, deletion mapping of BNip3 excluded its putative BH3 domain and identified the NH 2-terminus and TM domain critical for Bcl-2 heterodimerization, and either region sufficient for Bcl-xL interaction. Similar mapping studies of CeBNip3 demonstrated its association with CED-9 and Bcl-xL exclusively through its TM domain. Both BNip3 and CeBNip3 induce cell death in several cell lines. Yet, the removal of the BH3-like domain in either protein does not diminish its cytotoxicity. Some Bcl-2 homologues form homodimers through regions of shared homologyto regulate their functio . Following 'in vitro' transcription/translation, BNip3 was expressed primarily as a 60 kDa protein along with a 30 kDa product. Interaction of BNip3 monomers was observed in the yeast two-hybrid system and deletion mapping localized the region mediating homodimerization to the TM domain. The BNip3 TM domain is also critical for mitochondria) targeting and cell death function. Its removal results in cytosolic expression and eliminates both its homologous interaction and cytotoxicity. Several BNip3 TM domain mutations were found to disrupt SDS-resistant BNip3 homodimerization, but did not interfere with its mitochondria) localization or killing activity. The substitution of the BNip3 TM domain with cytochrome ' b5' targeting sequence directed protein expression to nonmitochondrial sites, promoting both cell death and Bcl-2/Bcl-xL heterodimerization. Therefore, the function of BNip3 is independent of homodimerization, but the TM domain is necessary for mitochondria) targeting and cell death function. In conclusion, BNip3 is a mitochondria) cell death-inducing protein, which although structurally related to the Bcl-2 family appears to heterodimerize and to induce cell death in the absence of its BH3-like domain. Thus, BNip3-related proteins define a new class of cell death proteins, which interact with Bcl-2, Bcl-xL and CED-9 and kill independent of a BH3 domain.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».