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Enregistrement W7071734808

The stress-induced nucleolar accumulation of hsc70 is mediated by specific signals, nucleolar chaperone networks and RNA

2012· dissertation· en· W7071734808 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésNucleolusCytoplasmFibrillarinChaperone (clinical)Heat shock proteinNucleusStress granuleMutantRNARibosome biogenesis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock cognate 70 kDa protein (hsc70) is a well conserved molecular chaperone involved in many physiological functions such as the stress response, protein folding, and protein transport. Moreover, hsc70 plays roles in human disease, such as cancer, neurodegenerative disease, heart and brain ischemia, and it also takes part in the aging process. With the help of co-chaperones and ATP hydrolysis, hsc70 can restore proper protein folding by binding to normally inaccessible hydrophobic residues on its target. Following heat shock, hsc70 traffics from the cytoplasm to the nucleoplasm. Hsc70 further accumulates in nucleoli during heat stress recovery. Using GFP-tagged portions of hsc70, I identified the nucleolar localization sequence (NoLS) of hsc70. Following quantification of the fluorescence signal, I showed that the nucleolar accumulation of different constructs varied. This allowed me to identify a heat inducible segment on hsc70, residues 225 to 297, which is sufficient for nucleolar accumulation during recovery from stress. The analysis of deletion mutants generated for segment 225-297 revealed that some constructs accumulated in the nucleolus constitutively, while others did not target GFP to nucleoli. Using pharmacological inhibitors, I also showed that PI3-kinase, MEK (MAP kinase kinase) and tyrosine dephosphorylation are involved in the hsc70 nucleolar accumulation process. The nucleolus is a well defined compartment in the nucleus that is dynamic and characterized by multiple functions. Nucleoli are currently at the center of important discoveries as they play a role in diseases such as cancer. The nucleolus participates in the control of cell cycle progression and viral infections, but its fundamental function is the assembly of ribosomes. Several thousand proteins have been identified in the nucleolus; however, as the nucleolus is dynamic, this composition depends on physiological and environmental conditions. My work focused on reviewing our knowledge of the possible chaperone networks present in the nucleolus. A new set of proteins, the nucleolar multitasking proteins (NoMPs), has been identified as chaperones that are necessary for the specific function of the nucleolus. These multitasking proteins include B23 and nucleolin. This work provided the basis for us to predict interactions between chaperones in the nucleolus.Many proteins of the nucleolus are dynamic: they can traffic to other cellular compartments when environmental conditions change. To define the mechanisms of hsc70 nucleolar accumulation during stress recovery, my work aimed at identifying the nucleolar binding partners of hsc70. I provided evidence that RNA plays a role for hsc70 nucleolar accumulation by treating heat shocked cells with detergent and RNase. Furthermore, inhibition of RNA polymerase I increased the retention time of endogenous hsc70 in the nucleolus. In further studies I examined the GFP-tagged hsc70 NoLS in transfected cells. This reporter displayed increased nucleolar accumulation and delayed release from the nucleolus during the recovery from heat shock when cells were treated with actinomycin D. On the other hand, RNA polymerase I inhibition was not sufficient to accumulate hsc70 or the GFP-tagged NoLS in nucleoli under normal growth conditions. In addition to the links between nucleolar RNA and hsc70, my research demonstrated that hsc70 and its NoLS bind to polyA+ RNA under normal growth conditions.Taken together, my studies advance our current understanding of the nucleolar accumulation of hsc70 during heat stress recovery. I identified important sequence elements, pathways and possible nucleolar anchors that contribute to hsc70 nucleolar accumulation. My work congregates important concepts that will likely be beneficial to human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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