The synthesis of small molecule tools to study biological processes
Notice bibliographique
Résumé
This thesis consists of three separate chapters with individual projects: 1. Chapter 1: Developing a Chemical Biological Approach to Study E3 Ligase Activity: This is the main project of this thesis; this project aims to develop a novel chemical approach to study the formation of PPIs (Protein-Protein Interactions) in cells. The PPI system that is of interest is the ubiquitin proteasome system (UPS), with the aim to develop a set of chemical tools to study the biological activity of E3 ligases that have been recently discovered as potential drug targets. 2. Chapter 2: Understanding the Mechanism of PTC-209, a Potential Protein Translation Inhibitor (completed at the University of Toronto): The project aims are to better understand mechanism of PTC-209, as currently the known mechanism of PTC-209 is not strongly supported. Utilising the aminothiazole central core that is present in PTC-209 as a building block and varying the fragments to help identify what causes the activity seen in literature. 3. Chapter 3: Synthesis of a Lysine Covalent Ibrutinib Derivative (completed at the University of Toronto): This project aims to find an alternative solution to effectively inhibit BTK for treatment of B cell tumours. With the aim to alter ibrutinib’s scaffold to overcome the current ibrutinib design that results in patient relapse and is explained by the mutation of the targeted residue.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,011 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».