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Enregistrement W7072249138

Upregulation of CaMKIIβ and Nogo-C mRNA in Schizophrenia and the Prevalence of CAA Insert in the 3âUTR of the Nogo Gene

2008· dissertation· en· W7072249138 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2008
Typedissertation
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMessenger RNAGeneGene expressionDownregulation and upregulationSuppression subtractive hybridizationComplementary DNAKinaseSchizophrenia (object-oriented programming)Cerebral cortexsplice
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schizophrenia may result from altered gene expression leading to abnormal neurodevelopment. In a search for genes with altered expression in schizophrenia, cDNA library subtractive hybridization experiments using post-mortem human frontal cerebral cortices from schizophrenia individuals and neurological controls were performed.\n\tI found the mRNA of two neurodevelopmentally important genes, Nogo (RTN4) and calcium/calmodulin-dependent protein kinase II beta (CaMKIIβ), to be overexpressed in post-mortem frontal cortex tissues from patients who suffered with schizophrenia. I used the quantitative real-time polymerase chain reaction method to determined the mRNA levels of these genes in tissues from age- and sex-matched individuals.\n\tNogo is a myelin-associated protein which inhibits the outgrowth of neurites and nerve terminals. The gene produces three splice variants, Nogo-A, B and C. I found Nogo-C mRNA to be overexpressed by 26% in schizophrenia. I also found a 17% reduction of Nogo-B mRNA in samples from individuals who had been diagnosed with severe depression. Furthermore, I showed that there is a direct correlation between the expression of both Nogo-A and -C and the presence of a CAA insert in the 3’UTR of the Nogo gene. \n\tCaMKII is a kinase localized at the postsynaptic density. The holoenzyme is primarily composed of the subunits α and β, encoded by two separate genes. It influences the expression of many neuroreceptors, in particular receptors of the glutamatergic pathway. CaMKII also mediates neural maturation during puberty, a time of onset of schizophrenia. The expression of CaMKIIα was elevated 29% in frontal cortex tissues of patients who suffered from depression. The expression of CaMKIIβ was elevated 27% in tissues of schizophrenia patients and 36% in tissues of patients diagnosed with depression. Upregulation of CaMKIIβ was associated with the presence of the CAA insert in at least one copy of the Nogo gene in a group containing both healthy subjects and patients with mental illness, possibly linking the CaMKII and Nogo pathways. The values for the expression of Nogo, CaMKIIα and CaMKIIβ were normalized to β-glucuronidase expression to minimize the effects of mRNA degradation. These results confirm that upregulation of Nogo-C and CaMKIIβ is likely associated with schizophrenia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,153
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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