LncRNA SRA1 may play a role in the uterine leiomyoma tumor growth regarding the MED12 mutation pattern
Notice bibliographique
Résumé
Mojdeh Akbari,1 Fakhrolmolouk Yassaee,2 Mona Aminbeidokhti,1 Atieh Abedin-Do,1,3 Reza Mirfakhraie1,41Department of Medical Genetics, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran; 2Department of Obstetrics and Gynecology, Taleghani Hospital, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran; 3GREB, Dental Faculty, Department of Regenerative Medicine, Faculty of Medicine, Laval University, Quebec, Canada; 4Department of Molecular Genetics, Genomic Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, IranCorrespondence: Reza MirfakhraieDepartment of Medical Genetics, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Koodakyar St, Velenjak Ave, Chamran highway, Tehran 19395-4719, IranTel/Fax +98 212 387 2572Email reza_mirfakhraie@yahoo.comFakhrolmolouk YassaeeDepartment of Obstetrics and Gynecology, Taleghani Hospital, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, PO Box 1985717413, Tehran, IranEmail Dr_fyass@yahoo.comBackground: Uterine leiomyomas (ULMs) are benign uterine tumors that are estrogen-dependent. Recent studies suggest that the abnormal expression of the steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA (lncRNA) might participate in the mechanisms of tumorigenesis of some hormone-dependent tumors including breast cancer. SRA1 is known to enhance the transcriptional activity of steroid receptors and also promotes steroidogenesis. The level of steroid hormones, such as estrogen and the progesterone, and their receptors play an important role in the development and growth of leiomyoma. The aim of the present study was to determine the expression level of lncRNA SRA1 in ULM tissues considering the MED12 mutation pattern.Methods: Mutation screening was performed for MED12 exons 1 and 2 and the intronic flanking regions using Sanger sequencing in 60 ULM tissues. Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCRs) was performed in order to estimate the expression of lncRNA SRA1 in leiomyoma samples with and without MED12 gene mutations. The expression results were analyzed by using LinReg and REST software.Results: Mutations were detected in exon 2 of the MED12 in 28 (46.67%) ULM samples; including, 21 (75%) missense mutations and 7 (25%) in-frame deletions. No mutation was detected in the MED12 exon 1. LncRNA SRA1 was over-expressed in ULM samples without MED12 mutation compared with ULM samples harboring MED12 mutation (Expression ratio=2.5, P-value=0.004).Conclusion: Present results suggest that lncRNA SRA1 may explain the phenotypic difference observed in the tumor size of ULM samples considering MED12 mutation pattern. Therefore, it serves as a good therapeutic target and provides new insight into understanding the disease molecular mechanism.Keywords: MED12, mutation, SRA1, lncRNA, uterine leiomyoma
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».