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Enregistrement W7074221496

Nicotine metabolism in the cabbage looper Trichoplusia ni (Hübner) - a toxicogenomic approach

2021· article· en· W7074221496 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueHigh-pressure geophysics and materials
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of British Columbia
Mots-clésCabbage looperTrichoplusiaDetoxification (alternative medicine)XenobioticCytochrome P450NicotineGlutathioneEnzymeInsect
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cabbage looper, Trichoplusia ni (T. ni) is a generalist insect (Lepidoptera: Noctuidae) that is an agricultural pest of crucifers and other crops of economic importance. In fact, over 70% of all agricultural pest insects are Lepidopterans. Although insecticides are effective at controlling insect populations by targeting the nervous system, they can have negative off-target effects. Cytochrome P450s (CYPs), glutathione S-transferases (GSTs), UDP-glucuronosyltransferases (UGTs), and carboxylesterases (CEs) are metabolic enzymes frequently implicated in insecticide resistance. These enzymes work in concert with transport genes such as ATP-binding cassette transporters (ABCs), organic cation transporters (OCTs) and multidrug resistance proteins (MRPs). Upregulation of detoxification enzymes and inhibited binding of insecticides due to target-site mutations are the main mechanisms causing insecticide resistance. Enriched metabolic detoxification of xenobiotics along with the subsequent development of insecticide resistance have been linked to the overexpression of CYPs in insects. Previous studies have suggested that generalist insect herbivores’ (e.g. T. ni) growth and development are inhibited by exposure to the plant alkaloid nicotine, whereas specialist insect herbivores (e.g. tobacco hornworm) are not affected. However, it has been shown that the Malpighian (renal) tubules of T. ni actively excrete nicotine. Recent research has shown that T. ni do in fact detoxify nicotine into the three major metabolites; cotinine, cotinine-N- oxide, and nicotine-N-oxide. The objective of this thesis was to utilize next-generation sequencing methods to establish a greater understanding of how nicotine, a model plant alkaloid, is detoxified by a generalist insect such as T. ni. This thesis showed that dietary nicotine exposure in T. ni resulted in the increased expression of a number of metabolic detoxification and transport-related gene candidates. CYPs in particular showed increased expression in response to nicotine in both midgut and renal tissues. A number of these showed high sequence similarity to previously published CYPs in other insect pests. Taken together these data provide further insights on how nicotine is metabolized and excreted by T. ni. This research will increase opportunities for the development of new biochemical and physiological targets for the control of insect agricultural pests and disease vectors which are economically, environmentally, and medically significant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,155
Écart entre enseignants0,147 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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