Special Issue: Emerging Wildlife Viral Diseases
Notice bibliographique
Résumé
[Extract] The past several decades have seen the emergences of novel viral infectious diseases increase steadily in wildlife populations globally [1,2,3,4,5,6,7,8]. Emerging viral diseases are acknowledged as an apparently growing trend of threats to wildlife and act as the source of a series of high-impact diseases recently emerging as pathogens affecting humans [9]. Most emerging viral pathogens, including Ebola and Marburg virus, human immunodeficiency virus virus-1 and -2, Nipah, Sin Nombre virus, Hendra and Menangle virus, West Nile virus, Middle East respiratory syndrome, and different subtypes of avian influenza, originate in wildlife and spill over into human hosts due to a range of ecological, demographic, and socio-economic changes [10]. Diseases caused by viruses, recently exemplified by the spread of SARS-CoV-2 (COVID-19) to human populations, also threaten wild animals from amphibians to mammals [8]. Habitat destructions, pollution, and international trade are among the factors contributing to a growing opportunity for viruses to spread to new hosts and cause disease. Three independent studies deal with the emergency of novel viruses such as the protoparvovirus [11], a number of mongoose-associated circoviruses and cycloviruses [12], and a poxvirus, cheloniid poxvirus 1 (ChePV-1) [1]. Using various deployed approaches, the detected novel Newlavirus, a protoparvovirus of foxes in Newfoundland and Labrador, was shown to be 38.7–54.1% identical to the members of the genus Protoparvovirus, compared to NS1 proteins [11]. Although some aspects of novel protoparvovirus ecology were examined, future studies will require the assessment of the host specificity and its geographical distribution. In a study on Circoviridae [12], 76 of 83 of apparently healthy small Indian mongooses were investigated using PCR and determined complete genomes of three mongoose-associated circoviruses and six cycloviruses. Although the detected circoviruses in this study show a strong phylogenetic congruence with other animal and human origin circoviruses, it is unknown whether the detected circoviruses/cycloviruses have the ability to replicate in the mongoose host or are derived from dietary origin during prey–predator interaction [12].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,076 | 0,038 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».