MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7079468845 · doi:10.26108/y3nb-tn24

Exploring stress biomarkers in an avian model

2017· article· en· W7079468845 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueAcadiaU-DEV · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueGeochemistry and Geologic Mapping
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuperoxide dismutaseBiomarkerEnzymeStress (linguistics)Oxidative stressHeat stress

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biomarkers are measurable biological molecules that can be used as indicators of stress in animals. Presently, there is little understanding of stress biomarkers in birds. The objective of this study is to identify changes in unique proteins in an avian model to further our understanding of the stress response in Aves. The models chosen in this study were the Herring Gull (Larus argentatus) and Great Black-Backed Gull (L. marinus). Specimens were obtained from the St. John's International Airport, Newfoundland and Labrador, Canada. Samples of liver tissue were ground in a mortar and pestle under sterile conditions to extract soluble proteins. Protein concentrations were normalized and 1D SDS-PAGE followed by a modified silver staining method were used to identify individual protein profiles. Gels were imaged and digitized using a Fluor-STM Multi-imager. Protein spots were excised from the gels and further analyzed using liquid chromatography-mass spectrometry/mass spectrometry (LC-MS/MS). Preliminary MS data indicates the presence of known stress proteins, including heat shock-70, heat shock-90, anti-oxidants such as superoxide dismutase and, pyridoxine phosphate oxidase (an essential enzyme in vitamin B6 metabolism). These proteins will be quantified by immunoblotting and used as targets to identify the effects of environmental stressors on the gulls. As our knowledge of stress in Aves is limited, these data will contribute to the broader understanding of stress in Aves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,737
Score d'incertitude au seuil0,529

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,146 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAcadiaU-DEVMême sujetGeochemistry and Geologic MappingTravaux en français237 207