A phylogenetic analysis of Black Queen Cell Virus demonstrating viral spread across native and wild bees in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Native and managed pollinators are vital to Canada's agriculture and biodiversity; however, these species are currently facing population declines. One of the most prominent viruses affecting the western honey bee (Apis mellifera) is Black Queen Cell Virus (BQCV), which is fatal to developing honey bee queens. Previous genomic analyses have shown that interspecies transmission of pathogens is common between managed honey bees and wild bumblebees, while the BQCV genotypes tend to be most similar within the geographic site where they were collected. The objective of this study is to trace the spread of BQCV across Apis and native bee species within Canada to better understand viral transmission in pollinators. Bees were collected from sites across Ontario, Alberta, and Nova Scotia and were tested for BQCV. Viral RNA was extracted and PCR was used to amplify viral cDNA targeting the helicase gene. PCR products were sequenced using the Illumina MiSeq Next-Generation Sequencing platform and sequences were analyzed for genetic similarity. Phylogenetic analysis revealed evidence of viral transmission across species and across collection sites. The viral sequences did not cluster neatly by province, though when compared to internationally collected sequences, they did cluster by country. These results suggest pathogen spillover between managed and native bee species across Canada, and that infected wild bees act as carriers for viral transmission even when appearing asymptomatic. Broader genomic analyses are needed to explore the transmission of BQCV across Canada, as the global data set remains limited.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».