Dataset from a Systematic Literature Review and Meta-Analysis of Genetic Factors in Endometriosis
Notice bibliographique
Résumé
Description This dataset accompanies a systematic literature review (SLR) and meta-analysis examining the role of genetic factors in endometriosis. The central research question was: “To what degree is endometriosis a hereditary disease?” Systematic searches were conducted using the Medical Subject Headings (MeSH) terms: (“endometriosis”) AND (gene OR associated gene OR genetics OR hereditary OR inheritance). The dataset contains extracted study-level information, risk of bias assessments, and pooled results from included studies. It has been structured to promote transparency, reproducibility, and secondary analyses within the field of endometriosis genetics. Objective The dataset provides a curated and structured collection of studies examining genetic associations with endometriosis. By making this data openly available, it supports replication, data reuse, and further investigations into the genetic basis of endometriosis. Methods Search strategy: Searches were conducted in PubMed, Cochrane Library, Scopus, Medline, and CINAHL Ultimate up to March 20, 2025. Inclusion criteria: Studies involving reproductive-aged women (15–49 years) with surgically confirmed endometriosis and reporting genetic traits, gene mutations, gene expression, or inheritance patterns. Exclusion criteria: Non-human studies (animal or cell line); studies on adenomyosis or ovarian cancer; drug-related studies; those lacking genetic or inheritance components; case studies, reviews, or meta-analyses; articles without full-text access; publications in languages other than English; or studies with <10 participants or unreported sample size. Data extraction: Study design, population characteristics, genetic factors, and outcomes were extracted. Analysis: Where feasible, meta-analyses pooled effect sizes using a random-effects model. Supplementary Data Supplementary Data I: Protocol Supplementary Data II: Systematic Literature Review (one page per step of the process) Supplementary Data III: Newcastle-Ottawa Scale (NOS) assessment scoring Supplementary Data IV: Data Extraction and Analysis Citation If you use this dataset, please cite as: Sulayman, H. (2025) ‘Dataset from a Systematic Literature Review and Meta-Analysis of Genetic Factors in Endometriosis’. Zenodo. doi:10.5281/zenodo.17100919
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,111 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,007 | 0,009 |
| Bibliométrie | 0,022 | 0,030 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,139 | 0,009 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».