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Enregistrement W7083353579

Role of Dicer1-DependentFactors in the Paracrine Regulation of Epididymal Gene Expression

2025· other· en· W7083353579 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typeother
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueWireless Sensor Networks for Data Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaVanderbilt University
Mots-clésEpididymismicroRNAGene expressionParacrine signallingBiogenesisSpermRegulation of gene expressionGeneMicroarray analysis techniques
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dicer1 is an endoribonuclease involved in the biogenesis of functional molecules such as microRNAs (miRNAs) and endogenous small interfering RNAs (endo-siRNAs). These small non-coding RNAs are important regulators of post-transcriptional gene expression and participate in the control of male fertility. With the knowledge that 1) Dicer1-dependent factors are required for proper sperm maturation in the epididymis, and that 2) miRNAs are potent mediators of intercellular communication in most biological systems, we investigated the role of Dicer1-dependent factors produced by the proximal epididymis (initial segment/caput)-including miRNAs-on the regulation of epididymal gene expression in the distal epididymis regions (i.e. corpus and cauda). To this end, we performed comparative microarray and ANOVA analyses on control vs. Defb41(iCre/wt); Dicer1(fl/fl) mice in which functional Dicer1 is absent from the principal cells of the proximal epididymis. We identified 35 and 33 transcripts that displayed significant expression level changes in the corpus and cauda regions (Fold change > 2 or < -2; p < 0.002), respectively. Among these transcripts, Zn-alpha 2-glycoprotein (Azgp1) encodes for a sperm equatorial protein whose expression in the epididymis of Dicer1 cKO mice is significantly increased compared to controls. In addition, 154 miRNAs, including miR-210, miR-672, miR-191 and miR-204, showed significantly impaired biogenesis in the absence of Dicer1 from the principal cells of the proximal epididymis (Fold change > 2 or < -2; p < 0.01). These miRNAs are secreted via extracellular vesicles (EVs) derived from the DC2 epididymal principal cell line, and their expression correlates with target transcripts involved in distinct biological pathways, as evidenced by in silico analysis. Albeit correlative and based on in silico approach, our study proposes that Dicer1-dependent factors trigger-directly or not-significant genes expression changes in distinct regions of this organ. The paracrine control of functions important to post-testicular sperm maturation by Dicer1-dependent factors may open new avenues for the identification of molecular targets important to male fertility control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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