Automatic Scientific Discoveries Using a Public Collection of Characterized Semantic Predications
Notice bibliographique
Résumé
Scientific literature contains a vast quantity of validated but fragmented knowledge. Literature-based discovery (LBD) aims to connect this dispersed information to generate new, valuable hypotheses. This paper presents a method for generating new scientific hypotheses by performing symbolic inference over a network of semantic predications-machine-readable scientific claims that are enriched with provenance and contextual metadata. The method constructs inference chains by linking multiple semantic predications from independently published sources. It accounts for specific properties of the predications to improve reliability, including a status of knowledge metric that we define and compute. The approach favors more robust and informative connections when generating hypotheses. To evaluate the quality of the hypotheses produced, we apply a temporal slicing methodology that assesses whether predicted relationships correspond to scientific claims published in the future. This approach enables direct comparison with established LBD methods. In a biomedical use case, our system achieves a Mean Average Precision (MAP) of 0.27 and a Precision@15 of 0.45, indicating the feasibility of interpretable, reusable scientific discovery through symbolic reasoning over structured knowledge.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,074 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,028 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,007 | 0,010 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».