Data and R code for the manuscript:Oli et al. (2025) Demographic mechanisms of snowshoe hare population cycles in Yukon, Canada. To be published in Journal of Animal Ecology.
Notice bibliographique
Résumé
The ZIP file contains the following files:1_hare_CMR_data_20251008_FINAL: Capture-mark-recapture data file that contains all information needed to fit multi-state capture-mark-recapture models.2_hare_CMR_code_20251008_FINAL.R: This script file reads the data files, and fits multi-state capture-mark-recapture models.3_hare_all_vital_rates_20251008_FINAL.rda: State-specific vital rates data that are needed to perform matrix model analyses.4_sensitivity and elasticity results_20251008_FINAL.csv: A CSV data file containing data on point estimates of state-specific vital rates, and sensitivity and elasticity of population growth rate to lower-level vital rates for each season and phase of the cycle.5_hare_MM_code_20251008_FINAL.R: R script to read vital rate data, and perform matrix model analyses.6_hare_MM_analysis_functions_20251008_FINAL.R: A R file containing functions sourced by 5_hare_MM_code_20251008_FINAL.R to perform standard matrix model analyses, and lower-level LTRE analyses.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,030 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,564 | 0,275 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».